El entrenamiento se considera fundamental para todos los perros guardianes, ya que su control es fundamental y su inexperiencia puede afectar su eficacia en situaciones inesperadas. Factores como la incapacidad de reaccionar ante la intrusión de un extraño, el miedo a una situación nueva, una técnica de mordida inadecuada y la falta de confianza en sí mismos, todos causados principalmente por la inexperiencia, se han reportado en casos reales de perros ineficaces. Solo en casos excepcionales, perros con una confianza natural muy alta han logrado repeler a los intrusos, pero a menudo sin la técnica de mordida más efectiva, lo que prolonga la pelea y causa daño a ambos. Al entrenar a un perro guardián, el adiestrador profesional y el ayudante (que usa ropa protectora y es mordido por el perro) buscan desensibilizar al perro, mostrándole nuevas situaciones con personas, objetos y sonidos, aumentando gradualmente el nivel de estrés, aumentando la confianza del perro, induciéndole la mejor manera de reaccionar y dónde morder, mejorando la técnica de mordida para que sea duradera, firme y con la boca llena, e incorporando órdenes de control, como las de atacar e interrumpir el ataque. En casos donde los intrusos más comunes son humanos, como en zonas urbanas, los perros guardianes medianos y grandes se entrenan simplemente para reprimir o inmovilizar al intruso mordiendo las extremidades superiores o inferiores e interrumpir el ataque bajo la orden de su dueño, cuando este llega.